Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms