Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms