Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms