Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms