Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCLMP48507 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCLMP48507 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms