Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGCXP38435 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGCXP38435 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGCXP38435 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGCXP38435 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGCXP38435 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGCXP38435 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGCXP38435 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms