Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms