Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2F2P13984 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2F2P13984 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2F2P13984 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2F2P13984 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2F2P13984 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2F2P13984 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2F2P13984 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms