Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms