Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM10L1P0DMW3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms