Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYNJ2O15056 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ2O15056 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms