Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms