Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms