Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms