Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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