Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms