Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms