Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms