Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms