Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms