Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSH3Q8TE77 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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