Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms