Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC89Q8N998 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC89Q8N998 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC89Q8N998 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC89Q8N998 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC89Q8N998 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC89Q8N998 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC89Q8N998 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC89Q8N998 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC89Q8N998 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC89Q8N998 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms