Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC33Q8N5R6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms