Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC117Q8IWD4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms