Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms