Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms