Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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SF3A1Q15459 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3A1Q15459 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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