Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CEP192-208ENST00000510237 6548 ntTSL 1 (best)9.29□□□□□ -0.923e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.933e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.937e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.947e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.943e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BCS1L-211ENST00000436603 552 ntTSL 39.19□□□□□ -0.942e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF611-205ENST00000595001 4796 ntTSL 1 (best)9.13□□□□□ -0.957e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.953e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.963e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SPOP-221ENST00000572686 2135 nt8.87□□□□□ -0.996e-14■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -13e-37■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 VMA21-203ENST00000477649 485 ntTSL 38.81□□□□□ -16e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ST7-217ENST00000446490 1694 ntTSL 58.78□□□□□ -13e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.046e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TSPAN31-202ENST00000546922 892 ntTSL 38.34□□□□□ -1.073e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.13e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CEP192-211ENST00000513432 8635 ntTSL 1 (best)8.16□□□□□ -1.13e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CEP192-215ENST00000589993 3284 ntTSL 58.12□□□□□ -1.113e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.127e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ST7-228ENST00000490039 1689 ntTSL 58.04□□□□□ -1.123e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RPL7L1-203ENST00000459829 801 ntTSL 27.7□□□□□ -1.182e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PPP2CB-207ENST00000520500 603 ntTSL 47.57□□□□□ -1.24e-19■■■□□ 15.2
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PABPC4Q13310 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.213e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC9A6-210ENST00000636625 3458 ntTSL 57.49□□□□□ -1.213e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.273e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 COA5-204ENST00000480666 958 ntTSL 27.11□□□□□ -1.273e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.283e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BLOC1S6-205ENST00000564310 636 ntTSL 36.68□□□□□ -1.343e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CRY1-205ENST00000552790 3834 ntTSL 26.65□□□□□ -1.343e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CEP192-209ENST00000511820 6455 ntTSL 1 (best)6.49□□□□□ -1.373e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 STYXL1-209ENST00000454618 663 ntTSL 1 (best)6.27□□□□□ -1.413e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.423e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 DNAJC12-204ENST00000480963 644 ntTSL 26.16□□□□□ -1.423e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.453e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC9A6-211ENST00000636798 3908 ntTSL 55.79□□□□□ -1.483e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.483e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 COA5-203ENST00000466848 481 ntTSL 35.74□□□□□ -1.493e-6■■■□□ 15.2
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PABPC4Q13310 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.533e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 VPS52-222ENST00000495981 743 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.553e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.593e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PPP2CB-202ENST00000518243 577 ntTSL 34.98□□□□□ -1.614e-19■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.687e-9■■■□□ 15.2
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PABPC4Q13310 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.743e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZGRF1-209ENST00000506675 2279 ntTSL 23.87□□□□□ -1.793e-6■■■□□ 15.2
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PABPC4Q13310 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.967e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 YIF1B-206ENST00000586319 936 ntTSL 320.78■□□□□ 0.927e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.857e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.487e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.467e-8■■■□□ 15.2
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PABPC4Q13310 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.254e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.114e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.224e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CCNK-204ENST00000555049 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.597e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CCNK-203ENST00000553865 5627 ntTSL 1 (best)9.9□□□□□ -0.827e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CCNK-201ENST00000389879 3524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.837e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ARHGDIB-207ENST00000541644 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.64e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ARHGDIB-203ENST00000536592 1063 ntTSL 310.06□□□□□ -0.84e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ARHGDIB-201ENST00000228945 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.954e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.425e-14■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.315e-14■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 OS9-208ENST00000546916 1028 ntTSL 224.66■■□□□ 1.541e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.571e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.121e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.041e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.011e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 OS9-202ENST00000315970 2691 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 OS9-210ENST00000549307 3870 ntTSL 210.27□□□□□ -0.771e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.231e-42■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.121e-67■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.041e-67■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.391e-67■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.281e-67■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.221e-67■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.191e-67■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-67■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.161e-67■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.061e-67■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ALDOA-211ENST00000564521 2534 ntTSL 514.28□□□□□ -0.121e-67■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ARL2-202ENST00000524585 1228 ntTSL 216.12■□□□□ 0.175e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 SEC11C-203ENST00000585864 1088 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.754e-6■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.723e-6■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 MRPL2-206ENST00000485654 428 ntTSL 216.35■□□□□ 0.213e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 PIP4K2A-205ENST00000474335 559 ntTSL 218.92■□□□□ 0.625e-8■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.185e-8■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 PSMB3-207ENST00000610434 510 ntTSL 313.41□□□□□ -0.261e-18■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.217e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.47e-9■■■□□ 15.1
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