Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms