Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms