Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MC1RQ01726 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms