Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms