Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms