Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMFBP60983 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms