Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXG1P55316 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms