Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGDP52209 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGDP52209 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGDP52209 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGDP52209 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGDP52209 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PGDP52209 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGDP52209 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGDP52209 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGDP52209 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGDP52209 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGDP52209 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGDP52209 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PGDP52209 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGDP52209 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGDP52209 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms