Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms