Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms