Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP1P23763 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms