Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms