Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms