Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB4P17483 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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