Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRAFP15056 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRAFP15056 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRAFP15056 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRAFP15056 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRAFP15056 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRAFP15056 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BRAFP15056 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRAFP15056 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRAFP15056 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRAFP15056 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms