Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL3A1P02461 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL3A1P02461 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms