Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL13O43927 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms