Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F3O00716 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F3O00716 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F3O00716 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms