Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms