Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIPT2A6NK58 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms