Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms